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Visium空間轉(zhuǎn)錄組

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項目介紹

Visium空間轉(zhuǎn)錄組測序是依靠10x Genomics Visium平臺，結(jié)合顯微成像、靶向探針捕獲、芯片和測序技術(shù)，從切片中獲取不同位置細胞中轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)，并將組織學(xué)和基因表達分析結(jié)合，通過數(shù)據(jù)處理進行基因表達和形態(tài)學(xué)數(shù)據(jù)的可視化。

技術(shù)原理

10x Genomics Visium的核心是利用空間表達芯片捕獲分子并標記空間位置和標簽，基因表達芯片包含4個點陣區(qū)域（6.5mm x 6.5mm），每個點陣含有4992個barcoded spot（直徑55um），每一個spot有一種空間定位條形碼。基因表達芯片上的組織切片透化后釋放mRNA被spot上對應(yīng)的條形碼原位捕獲，進一步文庫構(gòu)建和測序。測序數(shù)據(jù)中空間條形碼序列將轉(zhuǎn)錄信息映射回組織切片中的起始位置，從而還原轉(zhuǎn)錄本在組織中額位置分布，實現(xiàn)基因表達的空間可視化。

應(yīng)用方向

1、腫瘤研究

2、發(fā)育生物學(xué)

3、神經(jīng)科學(xué)

4、疾病免疫

樣品要求

詳情請聯(lián)系技術(shù)經(jīng)理。

項目案列

Histology and shared gene xpression factors in three cancer tissue sections

Spatial comparison of periphery and center of tumor transcriptomes

Stromal heterogeneity and reactive stroma in the microenvironment of inflammation

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