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項(xiàng)目介紹

蛋白甲基化（Methylation）能修飾組蛋白、轉(zhuǎn)錄因子等蛋白，參與基因表達(dá)調(diào)控、相互作用等多種過程中，其發(fā)生過程是在甲基酶的作用下將甲基轉(zhuǎn)移到蛋白質(zhì)的特定氨基酸殘基上。蛋白質(zhì)的甲基化通常發(fā)生在精氨酸和賴氨酸上，可同時連接最多3個甲基基團(tuán)，其單/雙/三甲基化的分子量會相應(yīng)增加14.02 Da/28.03 Da/42.05 Da。質(zhì)譜可準(zhǔn)確測定這些分子量的變化，檢測甲基化修飾肽段及位點(diǎn)的分析。 4D-label free甲基化修飾蛋白組學(xué)是基于timsTOF Pro質(zhì)譜儀，通過數(shù)據(jù)依賴性采集-同步累積連續(xù)碎裂（ddaPASEF）掃描模式進(jìn)行甲基化差異蛋白質(zhì)組學(xué)分析。4D-label free修飾組，利用了離子淌度分離，能根據(jù)分子的形狀、截面積屬性，可有效區(qū)分修飾同分異構(gòu)多肽，極大提高修飾的鑒定深度，以更少上樣量、更快掃描速度，實(shí)現(xiàn)蛋白質(zhì)組學(xué)在覆蓋深度、靈敏度、通量方面的全面性提升。

技術(shù)路線

蛋白質(zhì)甲基化通常發(fā)生在精氨酸和賴氨酸上，可同時連接最多3個甲基基團(tuán)，其單/雙/三甲基化的分子量會相應(yīng)增加14.02 Da/28.03 Da/42.05 Da。質(zhì)譜可精確測定這些分子量的變化，檢測甲基化修飾肽段及位點(diǎn)的分析。

技術(shù)優(yōu)勢

1. 4D技術(shù)加持，提高定量的準(zhǔn)確性、鑒定深度，更加適合微量樣本；

2. 克服標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)在樣本數(shù)量上的限制，靈活方便；

3. 技術(shù)平臺——基于代質(zhì)譜平臺（Bruker timsTOF pro），檢測速度提升近一倍；

4. 經(jīng)驗(yàn)豐富——超16年蛋白平臺服務(wù)經(jīng)驗(yàn)，擁有豐富的高水平項(xiàng)目文章；

5. 數(shù)據(jù)保證——采用進(jìn)口金標(biāo)抗體，數(shù)據(jù)結(jié)果穩(wěn)定可靠；

6. 系統(tǒng)解決方案——提供修飾組學(xué)至驗(yàn)證、上下游聯(lián)合分析，實(shí)現(xiàn)快捷”一站式”服務(wù)。

數(shù)據(jù)分析

1、標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)分析內(nèi)容

鑒定分析：鑒定與定量結(jié)果統(tǒng)計(jì);單個樣本蛋白質(zhì)鑒定結(jié)果統(tǒng)計(jì);韋恩圖。

表達(dá)差異分析：差異結(jié)果統(tǒng)計(jì);差異結(jié)果柱狀圖;火山圖;聚類分析圖。

多組的比較分析(組別>=3)：mufzz聚類;雷達(dá)圖;箱線圖。

功能分析：亞細(xì)胞定位;結(jié)構(gòu)域分析;GO功能分析;KEGG通路分析;互作網(wǎng)絡(luò)分析。

質(zhì)量控制分析：肽段離子質(zhì)量偏差分布、肽段例子得分分布、蛋白質(zhì)豐度比分布。

2、高級數(shù)據(jù)分析

功能分析：GSEA富集分析。

臨床藥物研究：藥物靶點(diǎn)注釋。

標(biāo)志物篩選：集成機(jī)器學(xué)習(xí)。

與臨床表征的聯(lián)合分析：熱圖;弦圖;ROC分析;WGCNA分析。

推薦應(yīng)用領(lǐng)域

1. 染色質(zhì)結(jié)構(gòu)以及轉(zhuǎn)錄調(diào)控；

2. 穩(wěn)定蛋白質(zhì)，調(diào)控蛋白轉(zhuǎn)錄以及結(jié)合活性、DNA復(fù)制和損傷；

3. 癌癥、衰老、老年癡呆等許多疾病密切相關(guān)，是表觀遺傳學(xué)的重要研究內(nèi)容。

樣品要求

項(xiàng)目案列

常見問題

學(xué)術(shù)文章

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