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項(xiàng)目介紹

蛋白泛素化修飾（Ubiquitination）常伴隨泛素-蛋白酶體降解，引起蛋白穩(wěn)定性變化，參與增殖凋亡、內(nèi)吞、免疫等各種生物調(diào)控過(guò)程。其發(fā)生過(guò)程是通過(guò)一個(gè)三酶級(jí)聯(lián) (E1-E2-E3)反應(yīng)，使得單或多個(gè)泛素分子連接到蛋白氨基酸（Lys）側(cè)鏈上，并常伴隨蛋白酶體降解，調(diào)控蛋白表達(dá)水平變化。發(fā)生泛素化修飾的賴氨酸共價(jià)連接泛素分子，即兩個(gè)甘氨酸K-ε-GG殘基，使分子量產(chǎn)生114.1 Da的質(zhì)量偏移。利用質(zhì)譜可準(zhǔn)確測(cè)定分子量是否發(fā)生114.1Da的質(zhì)量偏移，從而檢測(cè)泛素化修飾肽段及位點(diǎn)。 4D-label free泛素化蛋白組學(xué)是基于timsTOF Pro質(zhì)譜儀，通過(guò)數(shù)據(jù)依賴性采集-同步累積連續(xù)碎裂（ddaPASEF）掃描模式進(jìn)行泛素化差異蛋白質(zhì)組學(xué)分析。4D-label free修飾組，利用了離子淌度分離，能根據(jù)分子的形狀、截面積屬性，可有效區(qū)分修飾同分異構(gòu)多肽，極大提高修飾的鑒定深度，以更少上樣量、更快掃描速度，實(shí)現(xiàn)蛋白質(zhì)組學(xué)在覆蓋深度、靈敏度、通量方面的全面性提升。

技術(shù)路線

技術(shù)優(yōu)勢(shì)

1. 4D技術(shù)加持，提高定量的準(zhǔn)確性、鑒定深度，更加適合微量樣本；

2. 克服標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)在樣本數(shù)量上的限制，靈活方便；

3. 基于質(zhì)譜平臺(tái)（Bruker timsTOF pro），檢測(cè)速度提升近一倍；

4. 經(jīng)驗(yàn)豐富——超18年蛋白平臺(tái)服務(wù)經(jīng)驗(yàn)，擁有豐富的高水平項(xiàng)目文章；

5. 數(shù)據(jù)保證——采用進(jìn)口金標(biāo)抗體，數(shù)據(jù)結(jié)果穩(wěn)定可靠；

6. 系統(tǒng)解決方案——提供修飾組學(xué)至驗(yàn)證、上下游聯(lián)合分析，實(shí)現(xiàn)快捷”一站式”服務(wù)。

數(shù)據(jù)分析

1、標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)分析內(nèi)容

鑒定分析：鑒定與定量結(jié)果統(tǒng)計(jì);單個(gè)樣本蛋白質(zhì)鑒定結(jié)果統(tǒng)計(jì);韋恩圖。

表達(dá)差異分析：差異結(jié)果統(tǒng)計(jì);差異結(jié)果柱狀圖;火山圖;聚類分析圖。

多組的比較分析(組別>=3)：mufzz聚類;雷達(dá)圖;箱線圖。

功能分析：亞細(xì)胞定位;結(jié)構(gòu)域分析;GO功能分析;KEGG通路分析;互作網(wǎng)絡(luò)分析。

質(zhì)量控制分析：肽段離子質(zhì)量偏差分布、肽段例子得分分布、蛋白質(zhì)豐度比分布。

2、高級(jí)數(shù)據(jù)分析

功能分析：GSEA富集分析。

臨床藥物研究：藥物靶點(diǎn)注釋。

標(biāo)志物篩選：集成機(jī)器學(xué)習(xí)。

與臨床表征的聯(lián)合分析：熱圖;弦圖;ROC分析;WGCNA分析。

推薦組合產(chǎn)品

蛋白表達(dá)水平全面解析：轉(zhuǎn)錄組+蛋白組+泛素化組。

推薦應(yīng)用領(lǐng)域

1. 植物發(fā)育與抗逆；

2. 感染與免疫研究；

3. 衰老再生及退行性疾病。

樣品要求

項(xiàng)目案列

常見問(wèn)題

學(xué)術(shù)文章

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